Η αποκομιδή απορριμμάτων αποτελεί βασική αρμοδιότητα των δήμων στην Ελλάδα και διέπεται από τον νόμο 4412/2016 για τις Δημόσιες Συμβάσεις Έργων, Προμηθειών και Υπηρεσιών. Οι δήμοι προκηρύσσουν διαγωνισμούς για την ανάθεση της υπηρεσίας σε ιδιώτες αναδόχους, με συμβάσεις που συνήθως διαρκούν δύο έως τρία χρόνια. Σύμφωνα με την ισχύουσα νομοθεσία, οι δήμοι που εφαρμόζουν πρόγραμμα μηχανικής αποκομιδής υποχρεούνται να έχουν τοποθετήσει αντίστοιχους κάδους σε συγκεκριμένα σημεία.
Η διαχείριση απορριμμάτων στην Ελλάδα αντιμετωπίζει σοβαρές προκλήσεις το 2026. Το ποσοστό ανακύκλωσης στη χώρα διαμορφώνεται στο 20%, αρκετά χαμηλότερο από τον ευρωπαϊκό μέσο όρο που είναι 50%, ενώ στόχος της κυβέρνησης είναι η ανακύκλωση να ανέλθει σε ποσοστό τουλάχιστον 55%. Μέχρι το 2035, μόνο το 10% των οικιακών απορριμμάτων θα μπορεί να οδηγείται σε ταφή ενώ σήμερα το ποσοστό αυτό φθάνει στο 80%. Το τέλος ταφής από το 2026 διαμορφώνεται στα 35-45 ευρώ ανά τόνο, ανάλογα με τον αριθμό των κέντρων διαχείρισης αποβλήτων που λειτουργούν στην κάθε περιφέρεια.
Για τη Σαμοθράκη ειδικότερα, ο Δήμος αντιμετωπίζει προκλήσεις στην αποκομιδή απορριμμάτων, καλούμενος να εκτελέσει την υπηρεσία με περιορισμένο προσωπικό. Η θαλάσσια μεταφορά των σύμμεικτων και ανακυκλώσιμων απορριμμάτων του νησιού και η ταχεία επιστροφή των οχημάτων είναι απαραίτητη για να εξασφαλίζεται η αποκομιδή και η υγιεινή, ιδίως τη θερινή περίοδο.