Η κοπή δέντρων στην Αθήνα υπόκειται σε αυστηρό νομικό πλαίσιο που στοχεύει στην προστασία του αστικού πρασίνου. Για την κοπή δέντρου εντός οικοπέδου σε εντός σχεδίου περιοχή, ο ιδιώτης πρέπει να εκδώσει «έγκριση εργασιών μικρής κλίμακας» από την πολεοδομία με αίτηση που θα συντάξει υποχρεωτικά μηχανικός. Αν η κοπή υλοποιείται για οικοδομικές εργασίες όπως η ανέγερσης μιας οικίας, τότε πρέπει να συμπεριληφθεί στην οικοδομική άδεια. Συχνές είναι οι περιπτώσεις επιβολής προστίμων σε ιδιοκτήτες ή διαχειριστές για κοπή δένδρων, που εφαρμόστηκε χωρίς την έκδοση άδειας. Το πρόστιμο για παράνομη κοπή δέντρων μπορεί να ανέρχεται στο ποσό των 5.000 ευρώ.
Πριν από κάθε κοπή προηγείται υποχρεωτικά αυτοψία και σύνταξη τεχνικής έκθεσης από αρμόδιους γεωτεχνικούς υπαλλήλους, στην οποία καταγράφεται αναλυτικά ο λόγος απομάκρυνσης — είτε πρόκειται για φυτοϋγειονομικά προβλήματα, είτε για ζητήματα επικινδυνότητας, εκτεταμένη ξήρανση ή δομικές βλάβες. Οι δημότες μπορούν να υποβάλλουν αιτήματα στη Διεύθυνση Πρασίνου του Δήμου Αθηναίων μέσω της ηλεκτρονικής πλατφόρμας Novoville, και λαμβάνουν ενημερώσεις για την πορεία επίλυσης του μέχρι την οριστική του διευθέτηση. Πρόσφατα, στο σύνολο των 25.000 μουριών που υπάρχουν στα διοικητικά όρια του Δήμου Αθηναίων, έχουν εκδηλώσει συμπτώματα προσβολής περίπου 1.300 δέντρα από τα οποία 300-350 έχουν ξεραθεί ή έχουν τέτοιο μέγεθος προσβολής που θα πρέπει να κοπούν.
